המרכז הישראלי לנפגעי כתות הוקם ב-2006 על-ידי רמי פלר – עובדה שמוצנעת על-ידי המרכז עד היום, במהלך השנתיים הראשונות לקיומו קיבל המרכז יותר משני מיליון שקלים מפלר או מעמותת “המשרד לענייני חסד” (שפלר היה התורם היחידי שלה) – סכום שהיווה יותר מ-97% מהכנסתו. רכזת הפעילות של המרכז ולימים המנכ”לית שלו הייתה רחל ליכטנשטיין, אשר עבדה לפני כן ב”מחלקה למלחמה במיסיון” של ארגון “יד לאחים”, משנת 2006 רחל ליכטנשטיין פועלת בגוף הראשי שמנהל את המרכז הישראלי לכתות וגם אחראי על התאום של העבודה מול ארגון יד לאחים.
למרות שרחל ליכטנשטיין מצהירה על עצמה כמנהלת המרכז הישראלי לכתות ( שהוא גוף פרטי ללא שום תמיכה ממשלתית או הכרה רשמית כגוף המוכשר לטפל בתופעה זו) היא קשורה בטבורה לארגון הקיצוני- יד לאחים
הקשר של רחל ליכשטנטיין והפעילים הקיצוניים של ארגון יד לאחים
כפי שצוין- למנהלת המרכז הישראלי לנפגעי כתות יש קשר ישיר לא ניתן להכחשה לפעילי השטח הקיצוניים של ארגון יד לאחים, בינהם, בנימין קלוגר, אברהם ביטקין, דניאל וגליה גינרמן, אלכס ארטובסקי, רמי פלר, מאיר כהן,ג’ק טייטל, בני וולקן, ואהרון אפלבאום.